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甲亢的形态学检查方法主要有以下几种：
(1)彩色多普勒超声检查：目前临床上多采用彩色多普勒超声检查，其特点是利用多普勒效应测定甲状腺动静脉血流速度和记录血流波形，对于甲亢及其他甲状腺肿大相关疾病的诊断与鉴别具有一定的意义。
(2)B超检查：甲状腺结节性病变的B型超声图像可根据声波均匀、声波减弱等情况，也可分为囊性、实质性和混合性3类。B超检查是一种使用方便、经济安全的检查方法，近年来已广泛用于甲亢的筛选和随访，与同位素扫描比较虽然各有优缺点，但超声检查不受碘供应的限制，方法简单，快速准确，对人体无损害，具有突出的优点。超声检查的缺点是：不能清楚地显示病变的外形，不能鉴别病变的性质;虽然也能显示肿大淋巴结，但难以判断有无癌转移。
(3)CT检查：计算机体层摄影目前被认为在甲亢及甲亢性眼病的诊断和鉴别诊断方面具有重要价值。首先CT可排除肿瘤，其次在甲亢临床眼病不明显时可观察到眼外肌受累的情况。